脆性 X 综合征 - 致善生物 - 官网

脆性 X 综合征

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  • ME029 试剂盒能用于检测 FMR1 和 AFF2 基因的缺失和重复,并能分析男性标本中这些基因启动子的甲基化状态。本试剂盒不能用来分析这些基因三核苷酸重复的长度,后者可参考 www.asuragen.com 描述的方法。

    染色体 Xq28 上 FMR1(FRAXA)基因的缺失会导致脆性 X 综合症。该病是是智力障碍的一种常见诱因。染色体 Xq28 上 AFF2(FMR2,FRAXE)基因缺失的频率较低,且缺乏明确的表型,但包括了男性智力障碍。尽管 FMR1 和 AFF2 中很少的缺失是已知的,它们的发生频率也许被低估了,尤其是在很大的 AFF2 基因上。已有人描述了 AFF2 中的微小缺失或许是卵巢早衰的重要原因(Murray,A.etal.,1999,JMedGenet36:767-70)。这两个基因中最常见的缺陷是外显子 1 中三核 苷酸重复序列的延长。这种延长导致了经由基因启动子甲基化产生的基因沉默。虽然 MLPA 不能检 测这种三核苷酸重复片段的长度,但是可以定量检测基因启动子序列的某些 CpG 岛的甲基化。


    使用本试剂盒获得的结果表明,早从拥有完全突变(>200 重复片段)FMR1 基因的男性 DNA 样本中很容易检测促进部分甲基化。如果男性 DNA 样本存在 FMR1 基因突变(>200 个三核苷酸重 复),FMR1 启动子区域就会发生甲基化,该法可以准确地区分男性 FMR1 的前突变和完全突变。 对于女性 DNA 样本,印记 X 染色体的存在使得分析复杂,并且能很容易地导致假阳性结果。理论 上,在少于 200 个三核苷酸重复的女性中,50%的等位基因应该在 FMR1 的启动子发生甲基化,而 在完全突变的女性样本中,这一比例会增加到 75%。我们的研究显示,由于结果的差异性过高,具 有完全突变的女性样本无法 100%检出。对于甲基化定量而言,本试剂盒只能用于测试男性 DNA 样本。

    FMR1 基因(具有 17 个外显子)涵盖了 39kb 的基因组 DNA,位于 Xq27 上距离 p-端粒 146.8Mb的位臵。AFF2 基因(22 个外显子)涵盖了约 500kb 的基因组 DNA,位于距离 FMR1 末端着丝粒550kb 的位置。

    本试剂盒包含 27 条 FMR1 和 AFF2 的特异探针。其中 10 条探针包含 Hhal 识别位点,可提供 目标序列的甲基化状态信息。除检测异常甲基化之外,所有 27 条探针都会给出所分析的样品中拷 贝数变化信息。另有 12 条参考探针检测 FMR1/AFF2 区域外的基因,其中 2 条具有 Hhal 识别位点(酶切质控探针),大多数血液 DNA 样品中是未甲基化的,Hhal 消化后信号消失,可以用来确认Hhal 的完全酶切。