遗传性非息肉性结肠癌 - 致善生物 - 官网

遗传性非息肉性结肠癌

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  • 遗传性非息肉性结肠癌(HNPCC,Lynch综合征),主要由DNA错配修复基因MSH2和MLH1基因的胚细胞缺陷引起。在HNPCC家族中检测此类突变,有助于发现需要检测的成员,排除不需要检测的成员。检测HNPCC的MLPA试剂盒共有四种,覆盖了MLH1、MSH2、MSH6和PMS2四个主要的致病基因。


    ² P003:非息肉性结肠癌

    错配修复基因MLH1MSH2的胚细胞缺陷是HNPCC的主要病因。在一项筛查了126个结肠癌家系的研究中,发现30%的家庭检出胚细胞突变,13.5%发生一个或多个外显子拷贝数目变化。用本试剂盒检测了MLH1/MSH2外显子的缺失,发现该缺失在所有突变中占46%。另外,很多研究表明,MLH1MSH2的基因重排也是引起HNPCC的一个重要原因。

    MLH1基因包含19个外显子,横跨3号染色体p22.2长达100kbMSH2基因包含16个外显子,位于2号染色体p21长达73kbP003包含MLH1基因的所有19个外显子和MSH2基因的所有16个外显子的探针,另外包含了两条针对EPCAM基因(位于MSH2上有的基因)3端的外显子的探针,EPCAM基因3端外显子的缺失会导致MSH2基因的沉默。试剂盒中用作参照的7条探针位于其它染色体上。


    ² P008:非息肉性结肠癌

    P008试剂盒包含PMS2基因区域的探针。假基因的存在使得PMS2基因的分析相对复杂。PMS2和它的假基因在外显子131415上没有明显的序列差异。因此,要想设计出与PMS2的这些外显子100%特异的探针是不可能的。然而,我们的实验表明,PMS2及其假基因总的拷贝数在正常个体中是稳定的,因为PMS2上的杂交等位基因是由于一次古老的基因重组事件引起的。

    P008包括19条位于外显子111PMS2特异探针及五条PMS2PMS2CL外显子1215区域的探针。总之,这24条探针可以排查绝大多数样本的PMS2拷贝数变化。当然,对于外显子12-15上拷贝数的变化,这些探针无法确定是发生在PMS2上还是发生在PMS2CL上。另外本试剂盒也包括了10条探针,用以检测PMS2/PMS2CL基因外显子1115上的五个SNP位点等位基因的拷贝数。这些SNP的等位基因在PMS2及其假基因上的分布是不同的。对于外显子1112上的SNP,有一个等位基因几乎100%PMS2特异,而其它的等位基因则与其假基因特异。对于外显子1315上的SNP,两个等位基因在这两种基因上的分布几乎是均匀的。对这些SNP特异的探针进行的分析,并通过cDNA分析或者长程PCR分析加以补充,能够进一步指示外显子1315上的拷贝数的变化是发生在PMS2基因上还是发生在它的假基因上。P008还包括13条参照探针用以检测常染色体上的不同位点。


    ² P072:非息肉性结肠癌

    位于2号染色体p16MSH6基因也会引起遗传型非息肉结肠癌(HNPCC)。P072试剂盒的探针包括了MSH6上所有10个外显子,某些外显子包含了多条探针。此外,还有7条针对检测的是MSH2基因或其上游序列。以进一步确认外显子1的的缺失。4条位于MSH2上游的探针以及2条位于外显子9上的探针可以用来检测EPCAM基因(=TACSTD1)EPCAM基因3'端上的缺失能够引起MSH2基因启动子的甲基化以及MSH2基因的沉默。另外,针对MUTYH基因的3条探针和数条参照探针也包含其中。